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108.02 Distribuição de Palmitos


Os palmitos estão agregados na floresta?


Vamos usar os dados da posição de palmitos (Euterpe edulis ) adultos em uma parcela de 10,24 ha de floresta (320×320 m). A hipótese nula é que esses indivíduos se distribuem aleatoriamente no espaço. Abaixo reproduzimos o pseudo-código para que possa conduzir esse teste de aleatorização:


  • Baixe o arquivo palmadulto.txt e leia os dados no R em um objeto chamado palm, não esqueça de conferir se o objeto de dados foi lido corretamente e utilize o arguento as.is = TRUE.
  • Conte o número de árvores que estão no objeto palm e guarde no objeto nPalm.
  • Calcule a distância entre todos os indivíduosa dist e guarde no objeto distPalm, obedecendo a ordem dos indivíduos nos dados originais e com apenas uma casa decimal de precisão. Este objeto deve ser uma matriz.
  • Garanta que a matriz distPalm foi preenchida tanto no triângulo superior quanto no inferior e que as distâncias da árvore com ela mesma está preenchida com NAs mat.
  • Crie o vetor vizPalm para guardar a distância ao vizinho mais próximo de cada indivíduo, com precisão de uma casa decimal.
  • Calcule a média do vetor vizPalm e guarde no objeto medViz.
  • Crie o objeto nSim para guardar o número de simulações, no caso o valor 1000.
  • Crie o vetor resSim para guardar o resultado das simulações, preenchido com NAs.
  • Guarde o valor medViz na primeira posição do objeto resSim.
  • Crie um ciclo de iteração com o contador z que vai de 2 a nSim.

  • Dentro do ciclo:
    • Crie um vetor xSim com nPalm posições e preencha com valores de uma distribuição uniforme aleatória com os parâmetros min = 0 e max = 319.9, use a precisão de uma casa decimal.
    • Crie o objeto ySim da mesma forma que xSim.
    • Calcule a média ao vizinho mais próximo das coordenas cartesianas criadas acima, assim como fizemos para os dados (também use a precisão de uma casa decimal na matriz de distância), e guarde no objeto resSim na posição relativa ao contador z
    • Feche o ciclo.

  • Calcule o número de vezes que a média da distância ao vizinho mais próximo da simulação foi menor ou igual ao valor observado e guarde no objeto nAgr.
  • Calcule agora o valor de probabilidade de incorrer em erro ao afirmar que os palmitos adutos estão distribuídos de forma agregada na parcela e guarde no objeto pAgr.


dist a função dist pode ajudar muito nessa parte, veja o argumento upper!


mat as funções diag; upper.tri e lower.tri auxiliam na manipulação de matrizes!

Resposta

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