notas em linguagem R
204.1 Ajuste de Poisson e binomial negativa
Guarde os dados desse arquivo no objeto chamado
euterpe.Vamos ajustar um modelo poisson para o número de plântulas por parcela. Crie uma função chamada
plantula.poissonque aceita um parâmetro chamadolambdae retorna a log-verossimilhança negativa desse valor, dada a contagem de plântulas do arquivo.Use a função mle2 para minimizar a função plantula.poisson. Use um valor razoável como "start" (qual é o melhor chute para a distribuição poisson?). Guarde o resultado dessa otimização no objeto
mle.plantula.p. Importante: não use a função library no script entregue.Repita o procedimento ajustando uma distribuição binomial negativa ao número de plântulas por parcela.
Por fim, compare os valores de log-verossimilhança dos dois ajustes. Crie um objeto chamado
melhorindicando qual foi o
ajuste mais plausível, considerando o valor de verossimilhança ("p" para Poisson ou "nb" para binomial negativa).
O arquivo euterpe-regen.csv traz dados de regeneração natural do palmiteiro-juçara (Euterpe edulis) em 20 parcelas locadas aleatoriamente num trecho de Mata Atlântica. As colunas são a identidade da parcela e o número de indivíduos de quatro estádios de regeneração: plântula, muda, vara e arboreta (é necessário usar "skip=3" para ler o arquivo no R usando a função read.csv).